Tirsdag 8. juli 2014.- Et team av forskere fra Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR) har deltatt i en internasjonal undersøkelse som har identifisert 518 nye mikrobakterier, helt ukjente til nå, i den menneskelige mikrobiota (tarmflora).
Forskningen, der forskere har benyttet seg av en ny tilnærming til bioinformatisk analyse, har også utvidet katalogen over kjente mikrobielle gener, fra 3 til 10 millioner.
Resultatene fra denne forskningen, publisert på søndag av tidsskriftet Nature Biotechnology, er en del av det europeiske MetaHIT-prosjektet (Metagenomics Human Intestinal Tract), bevilget 11, 4 millioner euro for å undersøke hvordan det menneskelige mikrobiomet forholder seg til helse og sykdom . Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR) er en av 13 som deltar i dette prosjektet - og det eneste spanske senteret - under ledelse av Dr. Francisco Guarner, som forklarte at ikke alle prøvene som er studert har dette antall ukjente arter.
Prøvene av tarmfloraen til noen individer har svært få av disse artene, og når de analyseres i detalj, har de sett at de er prøvene til pasienter med Crohns sykdom. "Dette antyder at disse artene, hittil ukjente, muligens er de som utgjør forskjellen mellom mikrobiota hos friske mennesker og den av syke, " kunngjorde Guarner.
I følge forskeren åpner disse dataene for strategier for å prøve å gjenopprette disse artene med ernæringsmessige intervensjoner: administrering av fibre, prebiotika som hjelper den selektive veksten av noen arter eller probiotika.
Disse ukjente bakteriene er sannsynligvis av de såkalte "gode bakteriene" fordi de ikke er de typiske som forårsaker en infeksjon, og de er heller ikke kjent eller isolert før. Ifølge Guarner kan de oppdagede bakteriene ikke isoleres fordi "nesten helt sikkert ikke de ville overleve utenfor tykktarmen for å bli transplantert."
Personen som har ansvaret for arbeidet og forskeren til VHIR Group of Physiology and Digestive Pathophysiology har indikert at de nye artene som er oppdaget "ikke er dyrkbare, er veldig følsomme for oksygen, det vil si at de er veldig strenge anaerober og skaper en stor avhengighet av omgivelsene for å kunne overleve. " "Av samme grunn, da vi gikk til databasene, fant vi ikke spor, og før nå visste vi ingenting om dem, " sa Guarner.
Funnet har vært mulig takket være en ny tilnærming til bioinformatisk analyse som gjorde at disse artene kunne "overflate".
"Foreløpig - ifølge Guarner - er bare 10% av det sekvenserte genetiske materialet kjent med 95% pålitelighet. Dette etterlater et enormt grått område som det nå arbeides med."
Studien har påvist 741 forskjellige metagenomiske arter, oppkalt etter umuligheten av å tildele dem et navn. I kontrast til databasene, har forskere sett at 115 av disse artene allerede var kjent, mens 518 er ukjente; de resterende 108 er delvis kjent.
"Nå vet vi hvordan genomet til disse metagenomiske artene ser ut, men ikke navn og etternavn, " forklarte Guarner.
Det er et lite antall hvis arter ikke er kjent, men deres kjønn eller familien de tilhører, og omtrent 200 metagenomiske arter av de som er beskrevet, kan ikke klassifiseres på noen måte, siden mer enn 80% av genene deres er helt ukjente for. dag.
I følge forskere er mikroorganismene som lever i mennesker omtrent 100 milliarder, 10 ganger mer enn det totale antallet menneskelige celler.
De første resultatene fra samme prosjekt, i 2010, pekte på 3.300.000 forskjellige gener, oversatt til 20.000 forskjellige funksjoner, hvorav 5000 var helt ukjente så langt.
Hver person har omtrent 600 000 av disse mikrobielle gener, og 300 000 gjentas kontinuerlig blant alle individer. "I denne nye studien multipliseres antallet med tre og 9.879.896 forskjellige gener oppnås, " sa Guarner.
Kilde:
Tags:
Psykologi Ordliste Kjønn
Forskningen, der forskere har benyttet seg av en ny tilnærming til bioinformatisk analyse, har også utvidet katalogen over kjente mikrobielle gener, fra 3 til 10 millioner.
Resultatene fra denne forskningen, publisert på søndag av tidsskriftet Nature Biotechnology, er en del av det europeiske MetaHIT-prosjektet (Metagenomics Human Intestinal Tract), bevilget 11, 4 millioner euro for å undersøke hvordan det menneskelige mikrobiomet forholder seg til helse og sykdom . Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR) er en av 13 som deltar i dette prosjektet - og det eneste spanske senteret - under ledelse av Dr. Francisco Guarner, som forklarte at ikke alle prøvene som er studert har dette antall ukjente arter.
Prøvene av tarmfloraen til noen individer har svært få av disse artene, og når de analyseres i detalj, har de sett at de er prøvene til pasienter med Crohns sykdom. "Dette antyder at disse artene, hittil ukjente, muligens er de som utgjør forskjellen mellom mikrobiota hos friske mennesker og den av syke, " kunngjorde Guarner.
"Gode bakterier"
I følge forskeren åpner disse dataene for strategier for å prøve å gjenopprette disse artene med ernæringsmessige intervensjoner: administrering av fibre, prebiotika som hjelper den selektive veksten av noen arter eller probiotika.
Disse ukjente bakteriene er sannsynligvis av de såkalte "gode bakteriene" fordi de ikke er de typiske som forårsaker en infeksjon, og de er heller ikke kjent eller isolert før. Ifølge Guarner kan de oppdagede bakteriene ikke isoleres fordi "nesten helt sikkert ikke de ville overleve utenfor tykktarmen for å bli transplantert."
Personen som har ansvaret for arbeidet og forskeren til VHIR Group of Physiology and Digestive Pathophysiology har indikert at de nye artene som er oppdaget "ikke er dyrkbare, er veldig følsomme for oksygen, det vil si at de er veldig strenge anaerober og skaper en stor avhengighet av omgivelsene for å kunne overleve. " "Av samme grunn, da vi gikk til databasene, fant vi ikke spor, og før nå visste vi ingenting om dem, " sa Guarner.
Ulike metagenomiske arter
Funnet har vært mulig takket være en ny tilnærming til bioinformatisk analyse som gjorde at disse artene kunne "overflate".
"Foreløpig - ifølge Guarner - er bare 10% av det sekvenserte genetiske materialet kjent med 95% pålitelighet. Dette etterlater et enormt grått område som det nå arbeides med."
Studien har påvist 741 forskjellige metagenomiske arter, oppkalt etter umuligheten av å tildele dem et navn. I kontrast til databasene, har forskere sett at 115 av disse artene allerede var kjent, mens 518 er ukjente; de resterende 108 er delvis kjent.
"Nå vet vi hvordan genomet til disse metagenomiske artene ser ut, men ikke navn og etternavn, " forklarte Guarner.
Det er et lite antall hvis arter ikke er kjent, men deres kjønn eller familien de tilhører, og omtrent 200 metagenomiske arter av de som er beskrevet, kan ikke klassifiseres på noen måte, siden mer enn 80% av genene deres er helt ukjente for. dag.
En person har 600 000 mikrobielle gener
I følge forskere er mikroorganismene som lever i mennesker omtrent 100 milliarder, 10 ganger mer enn det totale antallet menneskelige celler.
De første resultatene fra samme prosjekt, i 2010, pekte på 3.300.000 forskjellige gener, oversatt til 20.000 forskjellige funksjoner, hvorav 5000 var helt ukjente så langt.
Hver person har omtrent 600 000 av disse mikrobielle gener, og 300 000 gjentas kontinuerlig blant alle individer. "I denne nye studien multipliseres antallet med tre og 9.879.896 forskjellige gener oppnås, " sa Guarner.
Kilde:
-gorczka-zachodniego-nilu-leiszmanioza.jpg)
