Onsdag 18. september 2013.- Forskere ved University of California, San Diego, i USA, foreslår en ny tilnærming kalt nettverksbasert stratifisering (NBS) for å identifisere kreftundertyper etter hvordan mutasjoner påvirker nettverkene eller genetiske systemene som deles i stedet for av entallmutasjoner av hver pasient, som publisert i søndagens avanserte digitale utgave av 'Nature Methods'.
Kreftsvulster deler nesten aldri de samme eksakte genetiske mutasjoner, et faktum som har forvirret vitenskapelig innsats for å klassifisere krefttyper bedre og utvikle mer spesifikke og effektive behandlinger.
"Undertyping er det mest grunnleggende trinnet mot målet om personlig medisin, " sa hovedforsker Trey Ideker, leder for divisjon genetikk ved University of California School of Medicine, San Diego, og professor i avdelingene i Medisin og bioingeniør av samme universitetssenter.
"Basert på pasientdata plasseres pasienter i undertyper med tilhørende behandlinger. For eksempel er det kjent at en kreftundertype reagerer godt på medisiner A, men ikke på medikament B. Uten undertyper har hver pasient den samme aspekt, per definisjon, og vi vet ikke hvordan vi skal håndtere annerledes, ”forklarte han.
Nyere fremskritt innen kunnskap og teknologi har gjort det lettere (og rimeligere) å sekvensere individuelle genomer, spesielt i behandling av kreft, som i grunnen er en sykdom i gener.
Men genene er "enormt heterogene, " sa Ideker. De muterte genene, påvirket av andre faktorer, forårsaker sykdommer som kreft, en patologi som er genetisk unik hos hver pasient, et faktum som kan påvirke effekten og resultatene av klinisk behandling.
"Når vi ser på pasientdata på gennivå, ser alle annerledes ut, " sa Ideker. "Men hvis du ser på nettverkene og de berørte biologiske systemene, ser de ut til å være klynger. Det er ingen muterte gener på samme sted, men mutasjonene vises i de samme genetiske traséene, " sa denne eksperten.
Spesielt observerte forskerne somatiske mutasjoner, til stede i svulster, men ikke i sunt vev, i data fra pasienter med kreft i lunger, livmor og eggstokker utarbeidet av Cancer Genome Atlas, et fortsettende program fra National Institutes of Amerikansk helse for å samle og katalogisere genomene til tusenvis av kreftpasienter.
Ideker sa at NBS-tilnærmingen har umiddelbar klinisk nytteverdi. Genomsekvensering av kreftpasienter blir raskt en standard del av diagnosen, så ifølge denne forskeren kan leger bruke NBS for å tilpasse en behandling med kreftundertypen bedre, og avhengig av resultatene av behandlingen, Ta med funnene tilbake til databasen for å avgrense og forbedre kreftbehandlinger slik at de blir mest mulig personlig for individene.
Kilde:
Tags:
velvære Skjønnhet Sjekk Ut
Kreftsvulster deler nesten aldri de samme eksakte genetiske mutasjoner, et faktum som har forvirret vitenskapelig innsats for å klassifisere krefttyper bedre og utvikle mer spesifikke og effektive behandlinger.
"Undertyping er det mest grunnleggende trinnet mot målet om personlig medisin, " sa hovedforsker Trey Ideker, leder for divisjon genetikk ved University of California School of Medicine, San Diego, og professor i avdelingene i Medisin og bioingeniør av samme universitetssenter.
"Basert på pasientdata plasseres pasienter i undertyper med tilhørende behandlinger. For eksempel er det kjent at en kreftundertype reagerer godt på medisiner A, men ikke på medikament B. Uten undertyper har hver pasient den samme aspekt, per definisjon, og vi vet ikke hvordan vi skal håndtere annerledes, ”forklarte han.
Nyere fremskritt innen kunnskap og teknologi har gjort det lettere (og rimeligere) å sekvensere individuelle genomer, spesielt i behandling av kreft, som i grunnen er en sykdom i gener.
Men genene er "enormt heterogene, " sa Ideker. De muterte genene, påvirket av andre faktorer, forårsaker sykdommer som kreft, en patologi som er genetisk unik hos hver pasient, et faktum som kan påvirke effekten og resultatene av klinisk behandling.
"Når vi ser på pasientdata på gennivå, ser alle annerledes ut, " sa Ideker. "Men hvis du ser på nettverkene og de berørte biologiske systemene, ser de ut til å være klynger. Det er ingen muterte gener på samme sted, men mutasjonene vises i de samme genetiske traséene, " sa denne eksperten.
Spesielt observerte forskerne somatiske mutasjoner, til stede i svulster, men ikke i sunt vev, i data fra pasienter med kreft i lunger, livmor og eggstokker utarbeidet av Cancer Genome Atlas, et fortsettende program fra National Institutes of Amerikansk helse for å samle og katalogisere genomene til tusenvis av kreftpasienter.
Ideker sa at NBS-tilnærmingen har umiddelbar klinisk nytteverdi. Genomsekvensering av kreftpasienter blir raskt en standard del av diagnosen, så ifølge denne forskeren kan leger bruke NBS for å tilpasse en behandling med kreftundertypen bedre, og avhengig av resultatene av behandlingen, Ta med funnene tilbake til databasen for å avgrense og forbedre kreftbehandlinger slik at de blir mest mulig personlig for individene.
Kilde:
