Mandag 24. juni 2013.-Forskere fra Australia og USA gir ny kunnskap til forståelsen av den tredimensjonale strukturen til genomet, en av de største utfordringene som for øyeblikket står overfor feltet genetikk og genetikk, hvis konklusjoner det publiserer i sin digitale utgave ' Naturgenetikk '.
Rundt tre meter DNA er tett brettet i kjernen i hver celle i kroppen vår, noe som gjør at noen gener kan "uttrykke" eller aktivere, unntatt andre. Legene Tim Mercer og John Mattick fra Garvan Institute for Medical Research i Sydney og professor John Stamatoyannopoulos ved University of Washington i Seattle analyserte 3D-strukturen i genomet med høy oppløsning.
Genene er sammensatt av "eksoner" og "introner", de første er sekvensene som koder og uttrykker proteinene, og de siste strekningene med ikke-kodende DNA i mediet. Når gener blir kopiert eller transkribert, blir DNA fra RNA kuttet eller "spleiset", og de gjenværende eksonene blir lenket sammen for å danne en sekvens som koder for et protein. Avhengig av hvilke eksoner som er spissete, kan det samme genet generere forskjellige proteiner.
Gjennom bruk av store datamengder fra ENCODE-prosjektet har Dr. Tim Mercer og kollegene hans trukket foldingen av genomet, og funnet at selv i et gen kan de valgte eksonene lett bli utsatt. "Se for deg en lang og umåtelig komplisert vintreet, dens vridde grener som presenterer noen druer som lett lar seg rive, mens du gjemmer andre utenfor rekkevidde, " gir han et eksempel. Mercer.
"Tenk deg samtidig en lat fruktplukker som bare plukker druene til fingerspissene - legger han til. Det samme prinsippet gjelder genomet. Spesifikke gener og til og med spesifikke eksoner er innen rekkevidde for å brette seg." I denne forstand påpeker denne forskeren at forskere i løpet av de siste årene har begynt å sette pris på hvordan genomfolding er med på å bestemme hvordan den uttrykkes og reguleres.
"Denne studien gir den første indikasjonen på at den tredimensjonale strukturen til genomet kan påvirke spleisingen av gener. Vi kan utlede at genomet brettes på en slik måte at promoterregionen, sekvensen som initierer transkripsjonen av et gen, er funnet ved siden av eksonene, og de blir alle ført til transkripsjonsmaskineriet, "understreker han.
"Dette støtter en ny måte å se på ting, som genomet bøyer seg rundt transkripsjonsmaskineriet, snarere enn omvendt. De genene som kommer i kontakt med transkripsjonsmaskineriet får kopier, mens delene som går i bane langt borte de blir ignorert, avslutter denne forskeren.
Kilde:
Tags:
Psykologi Kjønn velvære
Rundt tre meter DNA er tett brettet i kjernen i hver celle i kroppen vår, noe som gjør at noen gener kan "uttrykke" eller aktivere, unntatt andre. Legene Tim Mercer og John Mattick fra Garvan Institute for Medical Research i Sydney og professor John Stamatoyannopoulos ved University of Washington i Seattle analyserte 3D-strukturen i genomet med høy oppløsning.
Genene er sammensatt av "eksoner" og "introner", de første er sekvensene som koder og uttrykker proteinene, og de siste strekningene med ikke-kodende DNA i mediet. Når gener blir kopiert eller transkribert, blir DNA fra RNA kuttet eller "spleiset", og de gjenværende eksonene blir lenket sammen for å danne en sekvens som koder for et protein. Avhengig av hvilke eksoner som er spissete, kan det samme genet generere forskjellige proteiner.
Gjennom bruk av store datamengder fra ENCODE-prosjektet har Dr. Tim Mercer og kollegene hans trukket foldingen av genomet, og funnet at selv i et gen kan de valgte eksonene lett bli utsatt. "Se for deg en lang og umåtelig komplisert vintreet, dens vridde grener som presenterer noen druer som lett lar seg rive, mens du gjemmer andre utenfor rekkevidde, " gir han et eksempel. Mercer.
"Tenk deg samtidig en lat fruktplukker som bare plukker druene til fingerspissene - legger han til. Det samme prinsippet gjelder genomet. Spesifikke gener og til og med spesifikke eksoner er innen rekkevidde for å brette seg." I denne forstand påpeker denne forskeren at forskere i løpet av de siste årene har begynt å sette pris på hvordan genomfolding er med på å bestemme hvordan den uttrykkes og reguleres.
"Denne studien gir den første indikasjonen på at den tredimensjonale strukturen til genomet kan påvirke spleisingen av gener. Vi kan utlede at genomet brettes på en slik måte at promoterregionen, sekvensen som initierer transkripsjonen av et gen, er funnet ved siden av eksonene, og de blir alle ført til transkripsjonsmaskineriet, "understreker han.
"Dette støtter en ny måte å se på ting, som genomet bøyer seg rundt transkripsjonsmaskineriet, snarere enn omvendt. De genene som kommer i kontakt med transkripsjonsmaskineriet får kopier, mens delene som går i bane langt borte de blir ignorert, avslutter denne forskeren.
Kilde:
