Mandag 11. august 2014.- En internasjonal undersøkelse med spansk deltakelse identifiserer en mekanisme som hundrevis av mutasjoner blir introdusert i lunge- og kolorektale svulster.
Transduksjon av sekvenser i DNA er et lite kjent fenomen og anses sjeldent. Hovedpersonen er 50% av genomet kalt parasittisk DNA, dannet av elementer som tidvis replikerer seg og vandrer til andre steder i den genetiske sekvensen.
"Vi har observert at en spesifikk type sekvensoverføring relatert til et område i genomet kalt LINE-1 er ganske hyppig, spesielt i lunger og tykktarmskreftgenomer, " sier José Tubío, forsker ved Wellcome Trust Sanger Institute of Cambridge og den første signeren av artikkelen, som er publisert i tidsskriftet Science.
Sammen med ham, og som en del av en stor internasjonal gruppe forskere, har fire andre spanske forskere i Cambridge deltatt i arbeidet: Marta Tojo, Íñigo Martincorena, Jorge Zamora og Pablo Román.
For å nå denne konklusjonen utviklet forskerne en algoritme som identifiserer og lokaliserer opprinnelsen og de nye stedene til de mobile LINE-1-elementene.
"Å vite hvilke transponerbare elementer i genomet vårt som har aktivitet i svulster, og hvor de gjemmer seg, åpner dørene for utforming av medikamenter som demper den mutagene aktiviteten til disse 74 elementene i kreft, uten behov for å bruke bredspektrede medikamenter som kan påvirke andre. regioner i genomet, "sier Román, en av medforfatterne av verket og for tiden forsker ved HUCA i bein- og mineralmetabolisme.
På den annen side, "fant vi ut at det var epigenetiske forandringer knyttet til migrasjon av transponerbare elementer. Tatt i betraktning at epigenetiske endringer er nært knyttet til miljøet, peker dette arbeidet på en ny måte å ha sammenheng mellom genomet og hvordan vi spiser og puster.", sier Roman.
Med ordene fra Tubio, "vil det være nødvendig å foreta flere studier for å svare på spørsmålene som stilles av denne forskningen om de funksjonelle konsekvensene av mekanismen vi har observert, men det er ingen tvil om at dette funnet gir et nytt perspektiv av interesse for diagnose og behandling. kreftlege. "
Kilde:
Tags:
Medisiner Ordliste Skjønnhet
Transduksjon av sekvenser i DNA er et lite kjent fenomen og anses sjeldent. Hovedpersonen er 50% av genomet kalt parasittisk DNA, dannet av elementer som tidvis replikerer seg og vandrer til andre steder i den genetiske sekvensen.
"Vi har observert at en spesifikk type sekvensoverføring relatert til et område i genomet kalt LINE-1 er ganske hyppig, spesielt i lunger og tykktarmskreftgenomer, " sier José Tubío, forsker ved Wellcome Trust Sanger Institute of Cambridge og den første signeren av artikkelen, som er publisert i tidsskriftet Science.
Sammen med ham, og som en del av en stor internasjonal gruppe forskere, har fire andre spanske forskere i Cambridge deltatt i arbeidet: Marta Tojo, Íñigo Martincorena, Jorge Zamora og Pablo Román.
Plassering av de mest aktive elementene
Forskerne analyserte mobiliteten til LINE-1-elementer i 300 genom av 12 forskjellige typer kreft, og observerte at bare 74 av de 500 000 transponerbare elementene av type LINE-1 som er til stede i humant DNA, er i stand til å bevege seg i kreftgenomer. .For å nå denne konklusjonen utviklet forskerne en algoritme som identifiserer og lokaliserer opprinnelsen og de nye stedene til de mobile LINE-1-elementene.
"Å vite hvilke transponerbare elementer i genomet vårt som har aktivitet i svulster, og hvor de gjemmer seg, åpner dørene for utforming av medikamenter som demper den mutagene aktiviteten til disse 74 elementene i kreft, uten behov for å bruke bredspektrede medikamenter som kan påvirke andre. regioner i genomet, "sier Román, en av medforfatterne av verket og for tiden forsker ved HUCA i bein- og mineralmetabolisme.
Mobilisering av komplette gener
Som forskerne observerte, involverer sekvensoverføring som følge av aktiviteten til LINE-1-elementer noen ganger mobilisering av komplette gener og overføring av disse til andre regioner av DNA. Derfor endres strukturen, antall gener og genomuttrykk.På den annen side, "fant vi ut at det var epigenetiske forandringer knyttet til migrasjon av transponerbare elementer. Tatt i betraktning at epigenetiske endringer er nært knyttet til miljøet, peker dette arbeidet på en ny måte å ha sammenheng mellom genomet og hvordan vi spiser og puster.", sier Roman.
Med ordene fra Tubio, "vil det være nødvendig å foreta flere studier for å svare på spørsmålene som stilles av denne forskningen om de funksjonelle konsekvensene av mekanismen vi har observert, men det er ingen tvil om at dette funnet gir et nytt perspektiv av interesse for diagnose og behandling. kreftlege. "
Kilde: